前言
(nature重磅综述|关于rna-seq你想知道的全在这)()()()ggseqlogo,只要你根据此包要求的数据格式上传一堆dna序列或者氨基酸序列,再根据现成的命令流程就能画出logo图。
安装到作图的代码如下:
安装方式有两种
从github中安装devtools::install.github("omarwagih/ggseqlogo")seqs_aahead(seqs_aa) $akt1 "vvgarrsswrvvssi" "gprsrsrsrdrrrke" "llclrrsslkaygng" "terprpntfiirclq" "lsrervfsedrarfy" "pstsrrfsppssslq"也可以用自己的数据集,支持两种格式,矩阵。
长度为5的motif矩阵示例,每一列代表一个位置,及碱基在该位置的出现次数。共4行,每一行代表一种碱基matrix - "base 1 2 3 4 5a 10 2 0 8 1c 1 12 1 2 3g 4 0 9 1 1t 0 0 0 1 9"matrix_input - read.table(matrix, header=t, row.names=1)matrix_input - as.matrix(matrix_input)ggplot()+geom_logo(seqs_dna$ma0001.1)+theme_logo()
ggseqlogo支持以下几种类型数据输入:
下面是使用数据中的位置频率矩阵生成的seqlogo
ggseqlogo(pfms_dna$ma0018.2)

ggseqlogo提供函数make_col_scheme
来自定义离散或者连续配色方案csl - make_col_scheme(chars = c("a","t", "c", "g"), groups = c("gr1","gr1", "gr2","gr2"), cols = c("purple","purple","blue","blue"))ggseqlogo(seqs_dna$ma0001.1,col_scheme=csl)
cs2 - make_col_scheme(chars = c("a", "t", "c", "g"), values = 1:4)ggseqlogo(seqs_dna$ma0001.1, col_scheme=cs2)
ggseqlogo(seqs_dna, ncol = 4)
上述命令实际上等同于
ggplot()+geom_logo(seqs_dna)+theme_logo()+ facet_wrap(~seq_group,ncol = 4,scales = "free_x")通过创建矩阵可以生成每个标志的高度,还可以有负值高度
set.seed(1234)custom_mat - matrix(rnorm(20), nrow = 4, dimnames = list(c("a","t","c", "g")))ggseqlogo(custom_mat,method="custom",seq_type="dna")+ ylab("my custom height")
可以通过font
参数来设置字体,具体可参考?list_fontsfonts - list_fonts(f)p_list - lapply(fonts, function(f){ ggseqlogo(seqs_dna$ma0001.1,font=f)+ggtitle(f)})do.call(gridextra::grid.arrange,c(p_list, ncol=4))
注释的话跟ggseqlogo生成的图形与阅读原文跳转其博客。
更多数据可视化可参考在线工具:
1.debbie wingham手提包:由24k黄金制成,镶嵌了三颗巨大的粉钻,价值4000w。2.一千零一夜钻石包:包身是由18k的黄金手工打造,镶嵌了总达381.92克拉的钻石,价值2319w。3.爱马仕铂金钻石包:整个包身由大量的白金和钻石制成,镶有钻石的包链可以拆下来当珠宝佩戴,价值1160w。
1hermes爱马仕创于1837年巴黎,以生产丝巾和领带而闻名,其kelly包/birkin包/丝巾和领带等设计享誉国际,法国爱马仕(hermes)国际集团2lv路易威登始于1854年法国,皮革高超工艺集大成者,以其优质品质和原创精神享誉国际,产品包括手提包/旅行用品/小型皮具及个性化订制服务等,法国lvmh集团
出过很多包包的教程,今天这款包包的钩法还是很有特色的,虽然没有什么繁琐的花样,但整款包包非常挺括有型,而且并没有使用网格板。接下去我们就来看看这款迷你链条小箱包的具体钩法,示范用线:棉绳线(其它比较粗硬一些的线都可以),400g,6.0mm的钩针。我们先来钩包包的前片及两个侧板。起22针锁针,第1行:不加不减钩一行短针;第2行:1锁,翻面,每1针我们同时时挑上方辫子针的后半针,及下方行的半针(如图示)钩短针;第3行:1锁,翻面,重复第2行的钩法,仍然是同时挑上下行的半针来钩短针(注:挑的是钩的这行辫子针的
d成本包带长短改法。包带太长?搭配奇奇怪怪?今天分享多种0成本包带改法,看一遍学不会。宽带子丝巾系法:先把包带对折合适的长度,用丝巾打圈缠绕,绕完之后反方向从洞掏过去拉紧。下面也是同样的方式。后背下上身背它试式。上身背它是不是变短了?当然你也可以在肩部打结,上身展示看一下效果。这种链条包缩短方式更简单,链条在里面左右对折扣上包盖就好了,就变成一个腋下包了。
大家在买包 尤其是斜挎链条包的时候,是不是总会担心链条太长 背起来不适合自己的高度 更会感觉不适应 不舒服??这里和大家分享小编自己揣摩出来的 缩短包包铁链小秘诀 ~/ 需要准备一个小材料 — 文件夹 铁环扣 //这类 文件夹铁环扣 一般上在文具店就能找到喔 ~// 接下来,跟着以下步骤做 ///01 - 打开包包 将藏在里面的链条根据自己的舒适度调节,抓住多余的链条长度。
jennie开箱分享合集|轻松get明星同款好物||jennie做客vogue开包栏目,再度分享了她的chanel包包里有什么`色色r`里面的小东西真的满满的少女心评论区有惊喜!#包包##奢侈品##明星同款##tfboys十周年演唱会名场面#
前言我国大学生数量逐年增长,而随着生活水平的逐渐提高,大学生的生活费也随之增加。随之增加的不仅仅是生活费,而是大学生的物质需求。近几年大学生超前消费越来越普遍和流行,之前还有报道过大学生为满足自己的物欲需求借款最后还不上的,尽管如此,仍然未引起大学生的重视。攀比心态导致大学生的消费观念令人堪忧。但我们不能把整个现象归咎于大学生群体,还有不能忽视的外部因素,在“压榨”着大学生身上的“最后一根稻草”。
2010的时候,我特想买个某个大牌的太阳镜,就是飞行员系列的那款。当时的价格是2000,对于那个时候还是学生的我来说,非常昂贵,因为我每个月的生活费也就600。当时我着了迷,非得要买,省吃俭用存了大半年才攒够钱,托亲戚帮我从香港带回来。在还没拿到手的时候,我对它充满了期待,我认为它应该被包装得很高端,看起来非常有质感才对。
出老公前妻包。这些都是你老公前妻留的包包。对!当时这批包买买可能也要小20迈。他那个前妻贼败家也不是个什么好东西,所以我老公跟他离婚了属于财产划分给你的。因为这些都是我老公花钱买的,分的挺细的。我来给你一个价格给你。圣罗兰的曼哈顿,其实这个爆款现在还是挺流行的,空间容量也是足够大的。鳄鱼压纹的材质看起来也是很有高级感,使用感比较明显一些。
导语:形象创造价值,浪漫夏季,时尚型男们出街,衣服搭配固然重要但不能忽视的各种功能的包包也要考虑到风格与场合的搭配重要性在搭配之前,我们要了解各种包的功能与应用场景下的搭配技巧背包是最实用的包款了,适合日常通勤和旅行;手提包则更适合商务场合和正式活动;斜挎包则是休闲场合的首选。接下来,我将为大家介绍6款夏季必备包包的搭配指南,喜欢的小伙伴赶紧的收藏。